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利瑪竇中學學生會以服務學校為目的，隸屬校長，並由校長委派指導老師協助學生會及提供意見。會長帶領宣傳部、總務部、文書部、外務部為學校服務。

會員招募：為可持續發展及全人成長，於每屆學生會會長選舉時同時進行，使學生可透過學生會更 了解學校，以及回饋母校。

會長選舉：每一學年開始進行時，學生皆可報名參與，成為學生會會長候選人，並由全校師生以一人一票的形式，選出學生會會長，由會長帶領本學年學生會，服務校園。

 歷屆會長：

屆數	學年	會長	副會長
11	2008-2009	高健峰
12	2009-2010	李嘉榮
13	2010-2011	李嘉榮
14	2011-2012	夏棨峰
15	2012-2013	林偉星
16	2013-2014	曹俊傑
17	2014-2015	何耀東
18	2015-2016	曾俊賢
19	2016-2017	潘景昌	黃秀薇
20	2017-2018	潘景怡	馮嘉文
21	2018-2019	關文杰	胡彩藍、麥思霖
22	2019-2020	楊千慧	麥思霖、李諾瑤